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如何利用借助重組蛋白探索轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白抑制β淀粉樣蛋白聚集機制

發(fā)表時間:2024-07-03 訪問次數(shù):884

阿爾茨海默?。?/font>Alzheimers diseaseAD)俗稱老年癡呆癥,是一種典型的神經(jīng)退行性疾病,主要病理特征是腦萎縮和腦細胞死亡。該病自1906年被首次報道以來已有百年之久,目前仍未完全明確其發(fā)病機制,針對各種發(fā)病機制假說(如β淀粉樣蛋白級聯(lián)學(xué)說、Tau蛋白異常磷酸化學(xué)說、膽堿能學(xué)說、神經(jīng)炎癥等)的藥物研發(fā)目前也僅有AducanumabLecanemab被美國FDA批準上市。AducanumabLecanemab是通過清除AD患者大腦內(nèi)β淀粉樣斑塊而發(fā)揮作用的單克隆抗體藥物。研究表明,人體內(nèi)轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)對AD具有神經(jīng)保護作用,這種神經(jīng)保護作用能夠延緩AD的疾病進程。

轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(transthyretinTTR)負責(zé)甲狀腺素和視黃醇在人體內(nèi)的轉(zhuǎn)運工作。正常情況下,TTR是一種同源四聚體蛋白,其四聚體結(jié)構(gòu)非常穩(wěn)定。但當TTR四聚體解離成單體后,TTR單體會迅速發(fā)生錯誤折疊并聚集形成淀粉樣纖維,最終導(dǎo)致TTR淀粉樣變性,如淀粉樣心肌癥。盡管TTR的錯誤折疊與TTR淀粉樣變性密切相關(guān),但多項證據(jù)表明,TTRAD具有神經(jīng)保護作用。那么,TTRAβ二者作用的詳細機制如何?是否可為TTR神經(jīng)保護作用機制的抗AD藥物設(shè)計提供理論依據(jù)?

The initial structures for protein-protein docking

針對轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)和Aβ蛋白的研究,首先需要高質(zhì)量的蛋白滿足研究需求。武漢佰樂博生物(Biolab Reagents)作為普健生物旗下控股子品牌,專注于引進、整合全球業(yè)內(nèi)高品質(zhì)蛋白、抗體產(chǎn)品。作為法國ProteoGenix、Antibodysystem品牌亞洲區(qū)獨家運營代理商。提供近2萬種以蛋白、抗體為核心的生命科學(xué)試劑,旨在為生命科學(xué)科研工作者提供專業(yè)、全面、可靠的試劑產(chǎn)品。這項研究中,佰樂博不但可提供研究所需的針對轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)和Aβ蛋白,還可提供更多AD疾病相關(guān)的蛋白抗體試劑。

 

常見的形式有Aβ1-40Aβ1-42,但Aβ1-42在體內(nèi)的聚集傾向及細胞毒性更強,通常使用1-42來作為研究對象。該結(jié)構(gòu)是一個通過冷凍電鏡技術(shù)輔以固體NMR實驗獲得的近原子分辨率的纖維聚集體結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)中所有42個殘基的骨架和幾乎所有的側(cè)鏈在冷凍電鏡密度圖中都得到很好的解析。研究表明,較小的可溶性Aβ低聚體是Aβ細胞毒性的主要形式,因此在研究轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(transthyretin,TTR)與Aβ蛋白機制時,以五聚體作為Aβ低聚體的代表形態(tài)更具代表性。

為了獲得用于描述TTR/Aβ相互作用的復(fù)合物結(jié)構(gòu),進行蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)的分子對接。為探究TTR不同結(jié)構(gòu)形態(tài)對二者相互作用的影響,分別對TTR單體/Aβ單體、TTR四聚體/Aβ單體、TTR單體/Aβ五聚體及TTR四聚體/Aβ五聚體進行了分子對接,各體系分別標記為AβTTRMAβTTRT、AβOTTRMAβOTTRT。為了深入探究TTR的相互作用過程,進一步對各體系進行了分子動力學(xué)模擬。

The protein-protein docking models for each system

結(jié)果表明,TTR四聚體及單體均能與單體作用,TTR四聚體的甲狀腺素結(jié)合通道是單體的主要結(jié)合部位。此外,TTR四聚體的EF螺旋、EF loop同樣能夠結(jié)合單體。當TTR四聚體解離后,TTR單體的內(nèi)部片層疏水部位暴露,該部位對單體具有較強的親和力。TTR聚集體作用,由于TTR單體與聚集體均為富含β折疊的結(jié)構(gòu),使得二者能夠共聚集形成聚合度更高的聚集體,從而降低聚集體的細胞毒性。

The illustration of speculative interaction mechanisms between TTR and Aβ

這項研究表明,TTR結(jié)構(gòu)的特殊性使得其對Aβ單體具有較強的相互作用能力,可通過“扣押”單體的形式抑制Aβ的聚集。這種結(jié)構(gòu)特殊性表現(xiàn)為:a. 正常情況下TTR以穩(wěn)定四聚體形式存在,其結(jié)構(gòu)中的T4結(jié)合通道及視黃醇結(jié)合部位為Aβ提供了適當?shù)慕Y(jié)合空間,有利于Aβ單體的結(jié)合;b. 四聚體解離產(chǎn)生TTR單體,導(dǎo)致疏水界面DAGH折疊片層的暴露,使得Aβ單體同樣能夠作用于該疏水界面(Aβ單體的疏水核心為17LVFFA21),達到“扣押”Aβ單體的作用。其次,TTR單體的結(jié)構(gòu)特征與Aβ聚集體的結(jié)構(gòu)相似,均為富含β折疊的結(jié)構(gòu),這使得TTR單體能夠與Aβ聚集體共聚形成聚合度更高的無毒聚集體,從而達到抑制Aβ細胞毒性的效果。整體而言,本工作在原子尺度上探究了TTR與Aβ相互作用的機制,并揭示了TTR神經(jīng)保護作用的分子機制,在一定程度上為基于TTR神經(jīng)保護作用機制的抗AD藥物研發(fā)提供了理論線索。

 

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